輸出入手続きの流れとは？通関・書類・他法令の全体像を初心者向けにやさしく解説

最終更新日: 2026年7月2日

※本記事は公開時点の公的情報をもとに作成しています。制度・手続きは変わることがあり、貨物や取引の状況によって扱いが異なります。実際の手続きは、税関や所管の官庁、JETRO（日本貿易振興機構）などの公的機関に最新の内容をご確認ください。

貨物を海外とやり取りするには、税関への「通関」を中心とした一連の手続きが必要です。初めてだと複雑に見えますが、輸入も輸出も骨格は共通していて、全体像をつかめば整理できます。

この記事では、輸出入手続きの流れを、輸入・輸出それぞれの通関、必要書類、見落としやすい「他法令」の確認まで、税関やJETRO（日本貿易振興機構）の公式情報をもとにやさしく整理します。まず貿易の全体像を知りたい方は総合ガイド「貿易とは」（P0）を、見積りから決済までの商流全体は「貿易取引の流れ」（A2）もあわせてご覧ください。

輸出入手続きとは（通関が中心）
輸入の手続きの流れ
輸出の手続きの流れ
手続きに必要なおもな書類
「他法令」の確認を忘れずに
手続きは誰が行う？（通関業者の活用）
手続きをスムーズに進めるポイント
まとめ
1. 参考・出典

輸出入手続きとは（通関が中心）

貨物を国境を越えて動かすときは、税関に申告して許可を受ける手続き＝「通関」が必要です。通関は輸入・輸出の両方にあり、骨格はどちらも共通しています。

大まかには、「申告→審査→検査→（納税）→許可」という流れです。税関に申告し、書類の審査と必要な検査を経て、輸入なら関税などを納めたうえで、許可を受けて貨物を動かせるようになります。この通関そのものの詳しい解説は「通関とは」（B2）でも扱っています。ここでは、輸入と輸出それぞれの流れを並べて見ていきましょう。

輸入の手続きの流れ

外国から届いた貨物を国内に引き取るまでの流れは、次のとおりです（出典：税関）。

貨物の到着・保税地域への搬入：到着した貨物は、いったん保税地域（外国貨物を関税がかからない状態で置ける、税関の管理下の場所）に入れます。
輸入（納税）申告：貨物を管轄する税関官署に、品名・数量・価格などを申告します。
審査・検査：税関が書類を審査し、必要な貨物は検査を受けます。
関税・消費税等の納付：関税・内国消費税・地方消費税を納めます。
輸入の許可：納付が確認されると輸入が許可され、貨物を引き取れます。

輸入では、この「納税」が大きなポイントです。いくら納めるかは商品の分類（HSコード）と関税率で決まります。関税の考え方は「関税とは」（B3）で詳しく解説しています。

輸出の手続きの流れ

自国の貨物を海外へ送り出すときの流れは、輸入とよく似ていますが、納税の段階がありません（出典：税関）。

保税地域などへの搬入：輸出する貨物を保税地域などに入れます。
輸出申告：貨物の所在地を管轄する税関に、輸出申告書で申告します。
審査・検査：税関が審査し、必要な貨物は検査を受けます。
輸出の許可：許可を受けて、船や航空機に積み込みます。

輸出では関税の納付はなく、事業者の輸出取引は消費税も免除されます（輸出免税）。輸出をビジネスとして始めるときの準備や注意点は「輸出ビジネスの始め方」（E2）で整理しています。

手続きに必要なおもな書類

輸出入の申告には、いくつかの書類を添えます。代表的なものは次のとおりです。

仕入書（インボイス）：品名・数量・価格などを記した明細。申告価格の基礎になります。
パッキングリスト（梱包明細書）：荷姿・個数・重量などをまとめた書類。
船荷証券（B/L）・航空運送状（AWB）：貨物を船・航空機で運ぶ際の運送書類。
原産地証明書：EPA/FTA（経済連携協定）を使って関税を下げる場合などに必要になることがあります。

これらの役割や使い分けは「貿易書類の基礎」（B5）で、申告に欠かせない商品分類番号は「HSコードとは」（B6）で解説しています。

「他法令」の確認を忘れずに

初心者が見落としやすいのが「他法令」の確認です。関税に関する法律以外にも、貨物によっては別の法律で輸出入に許可・承認・検査が求められることがあります。

たとえば、食品なら食品衛生法、医薬品・化粧品なら医薬品医療機器等法（薬機法）、植物なら植物防疫法、絶滅のおそれのある動植物ならワシントン条約などが関わります。こうした「他法令」で手続きが必要な貨物は、税関が輸出入の際にその手続きが済んでいるかを確認します（関税法第70条／出典：税関）。該当しそうな商品を扱うときは、申告の前に所管の官庁へ確認しておきましょう。